در سال ۱۳۴۷، با همکاری چند نفر از فرهنگیان سرشناس، به صورت شرکت سهامی پایه گذاری شد. مدیر عامل این انتشارات از سال ۱۳۴۷ تا ۱۳۸۶ علیرضا حیدری بود. انتشارات خوارزمی در سال ۱۳۵۲، با اختلاف هایی که بین سهامداران آن پیش آمد تا آستانه تعطیلی پیش رفت. اما با دخالت عبدالرحیم جعفری، بنیان گذار انتشارات امیرکبیر که در آن سال، بخشی از سهام انتشارات خوارزمی را خریداری کرد، توانست به حیات خود ادامه دهد.
